10 ноября 1993 года Верховным Советом Республики Марий Эл было принято постановление «Об образовании Центральной избирательной комиссии по выборам депутатов Государственного Собрания – Кугыжаныш Погына Республики Марий Эл».

С этой даты начинает свою историю ЦИК Республики Марий Эл и начинается новый этап развития избирательной системы республики.

4 марта 1998 года был принят ныне действующий Закон Республики Марий Эл «О Центральной избирательной комиссии Республики Марий Эл». Законодательно определен статус ЦИК Марий Эл как постоянно действующего государственного органа республики, возглавляющего систему избирательных комиссий нашего региона.

В настоящее время работает 7 по счету (с 2016 по 2021 годы) состав Центральной избирательной комиссии республики.